
国家異常事態応急管理庁は、ネット上の終末小説の世界が実在し、その災厄が現実世界に広がりつつあることを察知。直ちにスカウト計画を始動し、各終末世界の主人公たちを集めて「終末特務班」を結成した。荒野の戦乙女、林晴矢が隊長を務め、その下には再生者の策士・黒川涼真、システム兵王・本多征爾、腹黒いヒーラー・白石優、血に飢えたゾンビ少年・アキ、予知能力を持つ少女・時田ミオといった、一筋縄ではいかないメンバーが集う。初の外部任務で各自が勝手に行動し大惨事を引き起こしたため、林晴矢は鉄の規律を敷いてチームを立て直す。チームがまとまりを見せる中、水面下では白石優が離間を画策し、二人の男性が林晴矢に想いを寄せるなど、不穏な動きが続く。林晴矢は、署長である陣内博文がメンバーたちの運命力を盗み、それを現世に捧げて神になろうとする陰謀を見破る。彼女は従うふりをして仲間たちと連携し、最終的に全員で反撃に成功する。林晴矢は自らの運命力を消費して終末の裂け目を封印し、メンバーたちは以後、現実世界を守る秘密の特務の刃となる。
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