借金を抱えた青年、林北斗は、家族が遺した廃動物園を引き継ぐが、園内の動物が実はS級の凶獣であることに気づく。彼は犬や猿を躾けるような原始的な方法で、思いがけず神獣たちを手懐けてしまう。借金、執行者、そして隠れた宗派からの追跡をかわす中で、次第に真の神獣の主として覚醒していき、ついには人類を率いて「獣潮」に立ち向かい、世界を守るのだった。
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