桃源村の陣内犬次郎はチンピラに突き落とされ、山神様に出会い神智を得る。山神様から善行で信仰ポイントを貯め、三つの伝承を解放するよう告げられ、善行を積む。『百獣の書』で獣医、『神農の書』で薬材栽培、村を豊かに。『玄黄の書』で人々を助け名声を得る。しかし、金山豹太、堂本天龍、竜崎浩介らが村の乗っ取りを企み、桃源村は危機に。出自が明かされ、謎の人物から殺害命令が下る。犬次郎は村を守るため、万獣の力で悪を退け、『神農の書』で商売を拡大し反撃。策略で金山豹太らを争わせ自滅させ、追手は『玄黄の書』の武術で打ち破る。信仰ポイントが上限に達し、犬次郎は山神の金身を得て桃源村を守護、平和をもたらす。
