少女、橘青葉は家族のために食料を探している最中、黒影山の樹の穴に落ち、千年後の現代にある長寿堂へとタイムスリップしてしまう。彼女は失われた古文書の修復技術、伝統的な生薬加工法、そして水波紋の錦の技術を頼りに現代で足場を固め、二つの世界を繋ぐ通路を利用して、食料、薬品、そして収量の多い種を飢饉に苦しむ故郷へと持ち帰る。村人たちを率いて織物工房を設立し、薬草組合を立ち上げ、一歩一歩と貧困から抜け出していく。デマによる危機に直面した際には、清水翔太が立ち上がり、科学技術で迷信を打ち破る。二人は手を取り合って支え合う中で、次第に恋心を抱くようになる。最終的に、橘青葉は寺子屋と済世堂を建て、清水翔太と千年の時を超えて愛を育み、古き村と現代の双方の繁栄を実現させた。
