主人公は転生後、四日後に怪異の力が覚醒し、亡者が屍魔と化し、学園のアイドル雪村結衣が旱魃になることを知る。彼は事前に雪村結衣の墓に忍び込み、口づけによってその力を手に入れ、思いがけず四大屍王の筆頭である真祖となり、屍王の威圧、不死不滅、殺戮進化という三つの能力を手にし、さらに旱魃となった雪村結衣を屍奴として服従させる。
終末世界が訪れた後、主人公は雪村結衣、服従させた屍王・蚩尤、血紋者の柳琴音らを率い、雪村結衣をいじめていた仇敵や様々な屍魔、そして挑発してくる桜花国の勢力を次々と討伐し、絶えず実力を高めていく。その過程で神跡の果実や不気味な亡霊といった特殊な存在を発見し、血の分身や神眼などのより強力な能力を解放。さらには避難所を設立して軍部と関わりを持つ一方、謎に満ちた白石紬などの隠れた勢力と遭遇し、次第にこの終末世界の背後に隠されたさらなる秘密を解き明かしていく。
