51歳の結城浩は、かつて「狂気の算仙」と呼ばれた最高の数学の天才だった。国の極秘任務を遂行した後に妻を失い、自閉症を患って20年以上も精神病院に閉じこもっていた。娘の結城瑞希は、父に捨てられたという噂を長年背負い、起業した会社が倒産寸前の時、母の遺言に従い父を迎え入れる。当初は恨みに満ちていた彼女だったが、父が次々と高難度の数学の謎を解くのを目の当たりにし、彼が半生を耐え忍んできた国への貢献を徐々に知っていく。父と娘は互いに癒し合い和解し、協力してビジネス界の闇や国外からの陰謀を打ち砕く。結城浩は再び数学の頂点に返り咲き、ついに過去の無念を晴らし、温かい家族の団欒を迎える。