世界的な猛暑で気温は60度を突破し、ゾンビウイルスが猛威を振るう。化学博士の森 凛は心血を注いでシェルターを建設したが、婚約者の高橋 明と親友の桜井 結衣に裏切られ、数箱の賞味期限切れのパンだけを渡されて家を追い出されてしまう。病気の母と幼い妹を連れた彼女は、事前に準備していた秘密の洞窟シェルターを起動させ、電気分解による水生成、水耕栽培、高圧電線などの自ら開発した技術を頼りに安定した生活を送る。一方、裏切り者たちは資源を浪費し、自らの防御を破壊。何度も放火を計画し、ゾンビを誘導して復讐を試みるが、次々と自業自得の結果を招く。森 凛は武装組織のリーダーである鳳と基地の創設者である雷堂と出会い、共にアーク基地の建設を計画し、土地を開拓して工場を建て、生存者を収容していく。基地が形になり始め、雷堂が彼女に想いを告げたその時、猛暑の終末が終わりを告げ、極寒の災害が突如として到来。全く新しい絶望的な状況がすべての人々を襲う。
