退魔師の家系、水無月家の生き残りである水無月咲良は、一族皆殺しの真相を調べるために第九皇子邸に嫁ぐが、夫である九条尊が九尾の狐であり、さらに彼を一族皆殺しの仇だと誤解してしまう。彼女は妖狐一族の女、柊柚葉が放った火事に乗じて死を偽装し、復讐のために天誅剣を探しに南の郷へ逃れる。その道中、妖狐一族の血を引く三人の子供を産む。九条尊は妻が死んでいないことに気づき、彼女を追いかける。二人は対峙する中で長年の誤解を解き、真犯人が柊柚葉、妖狐一族の大長老である葛葉千秋、そして敵対する退魔師の荒神家であることを知る。天誅剣がこの世に現れると、各勢力がそれを奪い合い、二人は協力して、荒神家と妖狐一族の裏切り者が共謀し、水無月家と九尾の狐一族を滅ぼした陰謀を暴き、ついに悪役を討ち果たす。水無月咲良は人と妖が共存する道を守り、九条尊を護り抜く。二人は手を取り合って退魔師界と妖狐一族を治め、子供たちを連れて世の不正を正す旅に出て、幸せな結末を迎える。