人里離れた黒霧の雨林には、敵対する3つの原始部族が住んでいた。平和を愛するクラウド族のレナは、聖なる泉を守ろうとして両親が殺されるのを目撃する。飛行機の墜落事故が近代的な物資をもたらした後、彼女は考古学者のイーライを救出し、知識を交換し信頼を深めていく。ボーン族の首長モーグは、外来の品々を欲し、虐殺を開始。レナは支持者を集め、彼が行う偽りの生贄の儀式を暴く。その後、彼女は考古学チームが地下の希少鉱物を採掘しようとしていることを知り、イーライとの間に亀裂が生じる。泉のほとりでの決戦で、レナは森の力を使いモーグを打ち負かす。イーライは採掘地図を燃やし、その地に残ることを決意。やがて3つの部族は団結して人身御供を廃止し、レナが女王となって、雨林に新しい時代が幕を開ける。